至于刚刚出现的那个巨人，自然由基地里的核心科学人员展开研究。他们的科学家果然不是吃素的，只经过很短的时间便发现了端倪 。
美女科学家赤木律子道：“刚才我把整个东京市的摄像头的录像调了出来，并且有所发现。”“说说看。”葛城美里好奇道，此时碇司令也来到了众人旁边，准备听听赤木律子的意见。
“大家请等一下。”赤木律子打开屏幕，很快就找到一段录像。录像开始播放，只见画面上出现了一位身着校服的年轻学生，赫然便是上条正在往零号机与水天使的作战地点跑去的身影。“这是市立第一中学的校服。”葛城美里分析道。
“如果没错的话，就是丽所在的那所中学的学生。”“你们看接下来的画面。”赤木律子指向屏幕，众人只见那屏幕上的身影停下来后并露出正脸，嘴里似乎说些了什么东西。
然后少年举起左手，右手交叉在左手上的一个奇怪的护腕上，少年在一道白光闪过后消失在屏幕当中。紧接着，赤木律子又调出一段录像：“你们再看接下来的画面。”众人抬头一瞧。
天空中出现红色漩涡，银色光球飞出，巨人现身。看看这两段视频的时间，漩涡几乎是在少年学生消失的同一时间就出现了，这两者之间会不会存在某种联系？
“这个学生消失之后巨人就出现了，你们说这两者之间会不会有些关系？”赤木律子提出自己的问题，“这可能吗？他只是个学生。”葛城美里却微微皱眉，“如果他只是一个普通的学生，为什么会有勇气跑向与使徒作战的地点？”赤木律子疑道。
“还有他所消失的时间几乎与巨人出现的时间一模一样，这难道是个巧合吗？”赤木律子言之有理，葛城美里顿时哑口无言，“美里，你去学校调查一下他的资料，记得要秘密调查。”
碇源堂想了想便下达命令，葛城美里点了下头又说道：“司令你的儿子也快来了吧？”“嗯。”碇司令用毫无感情的语气说道：“到时你去车站接一下他。”而在基地治疗室接受治疗的绫波丽已经苏醒，刚醒来身体上就传来一阵剧烈的痛感。
显然之前作战时受到的伤害无法在短时间内恢复。绫波丽下床后走出治疗室找到了葛城美里，询问自己昏迷后的情况。她直接调出录像并把作战时的状况简单说明了一下，看到屏幕中出现并营救自己的巨人，绫波丽小小的惊讶了一下。
葛城美里并没有把上条消失的画面播放出来，也没有告诉她调查的事情。绫波丽也没有多问就离开了基地，只是想到那个击败使徒的巨人就不由得想谢谢对方。
如果不是巨人的话自己可能已经死了吧，绫波丽直接坐电车回到旧城区自己住的地方。刚躺在床上不久便听到了敲门声，绫波丽下床打开门就看到少年的脸。
站在门外的正是上条，上条看见绫波丽手上缠着的绷带便担心道：“丽，你受伤了！”“嗯。”少女看到前来的是上条也稍稍惊讶了一下，“学校有记录你家的住址，下午你一直没来上课所以我就来看望一下。”
上条笑着说完后便打量着房间，窗帘都被拉上所以房间很是阴暗，地上有很多垃圾没有打扫，枕头边上还放着染血的绷带，上条随后注意到绫波丽的手臂和右眼都受了伤。
“你的伤是不是很严重？”上条扶着绫波丽坐到床边并关心地问道，“没事。”绫波丽显然不是第一次受伤，但上条听到那毫无情感波动的话语后心中莫名一痛。“怎么可能没事！都已经成这样了！”
上条的语气有点激动，“没事的。”但话还没有说完便被上条伸手打断，“我来帮你疗伤。”上条的右手放出柔和的银光且照耀在绫波丽的身上，绫波丽还没反应过来就感觉到伤痛渐渐消失。
少女的脸上浮现出一丝惊喜又意外的神色，而这时候上条已经放下了右手。“解开绷带看看吧，你的伤应该已经痊愈了。”上条微笑道，绫波丽依言拆开手上的绷带，眼前的是纯白如雪的肌肤。
伤口已经完全恢复，连一丝痕迹都未留下。绫波丽揭开右眼上的眼罩便用手指轻轻碰了下眼角，已经感受不到任何的疼痛。绫波丽的脸上泛起一丝仿佛能够融化坚冰的微笑。
她惊讶地询问道：“上条同学，你是怎么做到的？”上条微笑道：“你可以认为这是一种治疗魔法，还有以后不用这么叫我，叫我当麻就可以了。”“谢谢你，当麻。”少女清雅的面容显得十分欣喜。
虽然绫波丽从不在意自己的伤势但没人喜欢带着一身伤，只是她从未表现出来罢了。“不用谢，我们是朋友。”“嗯，我们是朋友。”两人相视一笑，“如果我没猜错的话，你是去与使徒战斗才受的伤吧。”
“嗯。”在绫波丽看来两人是朋友所以不需要隐瞒，上条正色道：“我不希望你再去战斗。”“不行的，与使徒作战是我的使命。”少女摇了摇头，上条见状也没有再说什么，环顾四周道：“我帮你打扫房间吧。”上条没等绫波丽开口便开始房屋大扫除。
上条在家务活上是把好手，房间很快便变得一尘不染。上条拨开窗帘看到天色渐暗便回头道：“丽，今天晚餐我来做吧。”“谢谢。”少女微笑道。不一会儿，餐桌上很快摆上了菜肴。
虽然厨房的素材不多但凑合一顿还是足够的。绫波丽吃着上条精心制作的简单而又美味的晚餐，心里泛起阵阵甜蜜。上条看着她的微笑，忍不住坐到她的身旁道：“丽，做我女朋友吧，我会保护好你。”
绫波丽突然被表白，有些手无足措地道：“我能保护好自己的。”“傻瓜，如果你能保护好自己的话那今天就不会受这么重的伤了。我喜欢你，丽，做我女朋友吧，我会一直保护你的。”
看着上条那真诚的语言和温柔的脸庞，绫波丽的脸上再度浮现出一丝微笑：“嗯。”上条听到这句话不由得伸出手来并温柔地抱紧绫波丽，而绫波丽也慢慢伸出手来搂住上条的腰。
夜幕降临，月亮初上，皎洁的月光铺撒在了东京市里。一道光芒照进窗户，照在那紧紧相拥在一起的少年与少女，似乎在为这对恋人做着虔诚的祈祷。