每集熟悉的开场白，永远活在片头曲中的男主角，伴随主题曲的插入，名侦探柯南新的一集，正式上映。
一辆正在行驶的列车，柯南跟着毛利小五郎和毛利兰以及三小只一起乘坐着这趟列车。
可突然，柯南注意到两个身着黑色大衣，头戴黑色帽子的人走进了列车内，瞬间惊恐，眼神犀利的注视着那两名可疑之人。
那两个人无论是穿着亦或者是气质，都给柯南带来一种紧迫感，与将自己变成这样的那两个简直一摸一样，尤其是他们的外貌，不能说毫不相干，但也是大差不差了。
柯南注视着他们的方向，注视他们走向自己的座位并坐下，期间不停的观察着他们，见对方二人离开位置，去上厕所的功夫，柯南悄悄的将**用口香糖包裹，粘在了座位上，这是阿笠博士交给柯南的最新发明。
带那两人回到座位后，柯南边启动了**，开始了窃听，在窃听过程中，他得知那两个人在列车上安装了炸弹，吓得柯南差点暴露了，幸亏他灵机一动化解了危。
在打消耗了那两位黑衣人的怀疑之后，柯南开始寻找列车上的炸弹。
经过长时间的苦苦寻找，柯南最终找到了炸弹的所在地点，但是那两个黑衣人已经离开了列车，不过不用担心，虽然已经提前下车，但那两个黑衣人依旧被警察抓了。
（虽然可能有点敷衍但是谁叫我把这一季的剧情给忘了忘的一干二净。）